Pod uwagę do głównej roli byli brani: Aidan Quinn, Ed Harris, Eric Roberts, Christopher Walken, David Carradine oraz Robert De Niro.
Rolę Marii Magdaleny odrzuciły: Kim Basinger i Sally Field.
Christopher Lloyd otrzymał propozycję zagrania jednego z uczniów Chrystusa, ale odmówił wzięcia udziału w produkcji.
Sting był kandydatem do roli Poncjusza Piłata. Billy Connolly chciał, by tę postać zagrał David Bowie.
Jeff Bridges ubiegał się o rolę Judasza. Natomiast gdy Martin Scorsese planował reżyserię filmu w latach 1983 / 1984, to Ray Davies został obsadzony jako zdradziecki uczeń Jezusa.
Tuż przed sceną chrztu Chrystusa z rąk Jana Chrzciciela widać cień kamery rzucony na Jezusa i inne postacie.
W pierwszych scenach, podczas których pojawia się postać Marii Magdaleny, można zobaczyć, że jej paznokcie są pomalowane czerwonym, lśniącym lakierem.
Podczas rozmowy Saula z Judaszem na rynku, można zauważyć cień należący do wysięgnika mikrofonowego. Znajduje się on na kamieniu za Saulem.
Podczas wizyty Jezusa w domu publicznym można zauważyć, że dobrze ubrany mężczyzna ma na sobie szkła kontaktowe.
Jeden z mężczyzn krzyczy, kiedy zostaje przybity do krzyża. Można wtedy zobaczyć, że ma w zębach metalowe plomby.
Film nakręcono w Maroku, w miastach: Ajt Bin Haddu, Marrakesz, Meknes, Oumnast i Warzazat, a także w górach Atlas.
W napisach czołowych Martin Scorsese zaznacza, że podstawą filmu jest powieść zmarłego w 1957 roku pisarza greckiego, Nikosa Kazantzakesa, a nie Ewangelia. Za napisanie Ostatniego kuszenia Chrystusa Kazantzakes został wykluczony z greckiej cerkwi prawosławnej. Scorsese przejął z powieści Kazantzakesa kluczową dla niej i filmu koncepcję postaci Jezusa. Koncepcja ta nie da się pogodzić z Chrystusem wiary. Chrystus Kazantzakesa i Scorsese jest człowiekiem jak wszyscy,a jego aspiracją jest normalne życie.
Universal Pictures zgodziło się wyprodukować "Ostatnie kuszenie Chrystusa " pod warunkiem że Scorsese zrobi dla nich komercyjny film. Tym filmem był "Cape Fear" nakręcony w 1991.
W scenie w której rzymscy żołnierze otaczają Jezusa w świątyni (jak mogłoby się wydawać) z każdej strony, w każdym ujęciu jest to ta sama piątka aktorów. Było to spowodowane oszczędnością gdyż film miał bardzo niski budżet.
Według reżysera Martina Scorsese efekt w ostatnim ujęciu nie był celowy. Kamera użyta do nakręcenia tej sceny była wadliwa co spowodowało dostanie się światła i zdeformowanie nagrania. Nie zostało to odkryte do momentu w którym film był już przetworzony.
Willem Dafoe stracił wzrok na trzy dni, ponieważ zaaplikowano mu zbyt wiele kropli do oczu. Krople miały nadać oczom aktora nadludzkiego wyglądu, poprzez utrzymanie rozszerzonych źrenic w pełnym słońcu.
Żydzi w filmie mówią z amerykańskim akcentem, a rzymianie z brytyjskim.
Film został zakazany w Chile (do 2002 r.), na Filipinach, w RPA i w Singapurze.
Film miał być w 1983 r. wyprodukowany przez Paramount. W roli Piłata obsadzono Stinga. Przed rozpoczęciem zdjęć projektu zaniechano gdyż wytwórnia przestraszyła się protestów ortodoksyjnych środowisk chrześcijańskich.
Okres zdjęciowy trwał od 15 października do 20 grudnia 1987 roku.
Martin Scorsese planował nakręcenie dłuższego filmu o życiu Jezusa Chrystusa, począwszy od jego dzieciństwa.
Universal Pictures przełożył datę premiery, aby wykorzystać rozgłos wokół filmu.